DAILY PAPER REVIEW

0813_Force Field for Molecular Dynamics Computations in Flexible ZIF-8 Framework

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  • Title & Journal

Title : Force Field for Molecular Dynamics Computations in Flexible ZIF-8 Framework

Journal : The Journal of Physical Chemistry C

  1.      Background of authors
  2. Authors : Bin Zheng, Marco Sant,* Pierfranco Demontis, and Giuseppe B. Suffritti

  3.      Summary

이 논문은 ZIF-8의 flexibility를 고려하여 ZIF-8의 lattice parameter, 질소기체의 확산 계수를 분자동역학 시뮬레이션을 이용하여 계산한 것이다. Linker rotation을 고려 하기 위해 force field에서 torsion term을 무시하거나 0으로 두어 guest-host interaction으로 imidazolate linker가 회전할 수 있도록 하였다. Partial charge에 대한 계산에서는 연구그룹이 직접 만든 코드를 이용하여 계산하였다. 이를 가지고 ZIF-8의 lattice parameter를 계산한 기존의 실험 연구와 비교하였으며, N2의 확산에 대해서도 실험 결과 및 다른 partial charge 계산 방법과 결과를 비교하였다. 논문에서 사용한 계산은 기존의 계산을 이용할 때 보다 시뮬레이션의 결과가 실험 결과와 잘 맞았다.

  1.      Application to our lab research

이 논문은 으로 분자동역학 시뮬레이션을 진행할 때 시스템을 어떻게 설정해야 하는지에 대해 나와있는 논문이다에 대한 계산 및 을 무시하여 를 고려한 것은 추후 시뮬레이션에서 고려해 보아야 하다

  1.      Contact

SeungJi Lim (Integrated Ph.D. program)

 

Environmental Systems Engineering Lab.

Department of Environmental Science & Engineering

Gwangju Institute of Science and Technology

1 Oryong-dong Buk-gu Gwangju, 500-712, Korea

 

Phone : +82-10-7935-8845

E-mail : fblsj90@gist.ac.kr


     Title & Journal
Title : Force Field for Molecular Dynamics Computations in Flexible ZIF-8 Framework
Journal : The Journal of Physical Chemistry C
     Background of authors
Authors : Bin Zheng, Marco Sant,* Pierfranco Demontis, and Giuseppe B. Suffritti
     Summary
이 논문은 ZIF-8의 flexibility를 고려하여 ZIF-8의 lattice parameter, 질소기체의 확산 계수를 분자동역학 시뮬레이션을 이용하여 계산한 것이다. Linker rotation을 고려 하기 위해 force field에서 torsion term을 무시하거나 0으로 두어 guest-host interaction으로 imidazolate linker가 회전할 수 있도록 하였다. Partial charge에 대한 계산에서는 연구그룹이 직접 만든 코드를 이용하여 계산하였다. 이를 가지고 ZIF-8의 lattice parameter를 계산한 기존의 실험 연구와 비교하였으며, N2의 확산에 대해서도 실험 결과 및 다른 partial charge 계산 방법과 결과를 비교하였다. 논문에서 사용한 계산은 기존의 계산을 이용할 때 보다 시뮬레이션의 결과가 실험 결과와 잘 맞았다.
     Application to our lab research
이 논문은 으로 분자동역학 시뮬레이션을 진행할 때 시스템을 어떻게 설정해야 하는지에 대해 나와있는 논문이다에 대한 계산 및 을 무시하여 를 고려한 것은 추후 시뮬레이션에서 고려해 보아야 하다
     Contact
SeungJi Lim (Integrated Ph.D. program)
 
Environmental Systems Engineering Lab.
Department of Environmental Science & Engineering
Gwangju Institute of Science and Technology
1 Oryong-dong Buk-gu Gwangju, 500-712, Korea
 
Phone : +82-10-7935-8845
E-mail : fblsj90@gist.ac.kr
  

 
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