1. Title & Journal

 Title : Cytometric methods for measuring bacteria in water : advantages, pitfalls and applications

 Journal : Anal Bioanal Chem

 

2. Background of author

 F. Hammes : South Africa, Pretoria 대학에서 학부 졸업하신 후 Belgium Ghent 대학에서 석사 와 박사를 수료하셨습니다. 현재, eawag에서 포스트닥터로 근무하고 계십니다.

 

3. Summary

 Cytometry는 cell 개수를 세어준다는 것을 의미하며, 이러한 과정에 이용되는 모든 기기들도 포함하는 것으로 정의된다. 그 중, Flow cytometry(FCM)는 기기에 미생물이 포함된 액체를 넣어줌으로서 흐름을 따라 지나가는 미생물의 개수를 세는 방법을 이용한다.

 FCM은 빠르고, 정확하고, 다루기 쉬우며 작은 것에도 반응한다는 민감성이 큰 장점이며, 단점으로는 바이오 필름과 같은 복잡한 미생물 군집에는 다루기 어려우며 데이터의 양이 많아서 데이터 처리에 시간이 걸린다는 점이 있다. 현재까지의 FCM은 전체적인 cell counting, cell size 측정, bacteria cell의 DNA와 RNA 분석, 박테리아의 생존력 분석, 특정 박테리아 그룹이나 종 측정등으로 이용되어져 왔다. 앞으로 FCM이 사용될 수 있는 분야에는, 각 구간에서의 실시간 모니터링(Quality control), 병원균 screening, 자연에서의 다양한 미생물 군집 분석, 비배양적 미생물의 detection등으로 이용되어 질 수 있다.

 

4. Originality & creativity

 이러한 FCM의 이용 목적에서, 우리 연구실에서는 viability 확인을 적용해 볼 수 있으며, total cell counting과 viability 확인을 동시에 하기 위해 SYBR GREEN I 과 Propionic iodide을 함께 이용해 실험을 진행하면 될 것으로 보인다.

 

5. Reviewer contact : 차민지 (mjcha@gist.ac.kr)